2021. Peña-Cortés F, Vergara C, Pincheira J, Aguilera, F & Gallardo N. Location factors and dynamics of tree plantation expansion in two coastal river basins in south-central Chile: Basis for land use planning. Journal of Land Use Science. http://dx.doi.org/10.1080/ 1747423X.2021.1882597. Publicado

2021. Campos M, Rilling J, Acuña J, Valenzuela T, Larama G, Peña-Cortés F, Ogram A, Jaisi D & Jorquera M. Spatiotemporal variations and relationships of phosphorus, phosphomonoesterases, and bacterial communities in sediments from two Chilean rivers. Science of The Total Environment, 776. https://doi.org/10.1016/ j.scitotenv.2021.145782. Publicado

2021. Pincheira-Ulbrich J, Andrade E, Peña-Cortés F & Vergara C Trees, shrubs and herbs of the coastal Myrtaceae swamp forest (Región de La Araucanía, Chile): a dataset. Biodiversity Data Journal 9: https://doi.org/10.3897/ BDJ.9.e63634

2021. Arévalo-Valenzuela P, Peña-Cortés F, & Pincheira-Ulbrich J Ecosystem services and uses of dune systems of the coast of the Araucanía Region, Chile: A perception study. Journal Ocean and Coastal Management, 200: 105450. Corresponding autor. https://doi.org/10.1016/ j.ocecoaman.2020.105450

2021. Maturana F, Morales M, Peña-Cortés F, Peña M Vielma C. Urban growth, real estate development and indigenous property. Simulating the expansion process in the city of Temuco, Chile. ISPRS International Journal of Geo-Information, 10(101): 1-16. https://doi.org/10.3390/ ijgi10020101

2020. Peña-Cortés F, Escalona M, Soria-Lara J, Pincheira-Ulbrich J, Salinas-Silva C and Alarcón F Translating sociocultural transformations into historical maps on land use changes: The case of Lafkenmapu (Araucanía, Chile) Journal of Maps. Publicado ISSN:1744-5647

2019. Barrientos C, Tapia J, Bertrán C, Peña-Cortés F, Hauenstein E, Fierro P & Vargas – Chacoff L. Is eating wild rainbow trout safe? The effects of different land-uses on heavy metals content in Chile. Environmental Pollution, 254, 112995. Publicado ISSN: 0269-7491

2019. Peña-Cortés F, Huiliñir-Curío V, Pincheira-Ulbrich J, Quintriqueo S, Quilaqueo D, Gutiérrez M & S Morales. Mapuche-Pewenche knowledge transmitted by teachers and parents: perception of schoolchildren in rural schools of the Araucanía Region (Chile). Journal of Multilingual and Multicultural Development, 40(3), 244-256.

2017. Fierro P., Bertrán C., Tapia J., Hauenstein E., Peña – Cortés F., Vergara C., Cerna C., Vargas-Chacoff L. Effects of local land-use on riparian vegetation, water quality, and the functional organization of macroinvertebrate assemblages Science of the Total Environment. 609, 724-734

2017. Peña-Cortés F, D Rozas-Vásquez, J Pincheira – Ulbrich & P Hepp. Priorización de territorios para la enseñanza-aprendizaje de las matemáticas en la Araucanía (Chile) Revista Perfiles Latinoamericanos, 25(49): 225 – 249

2016. Fierro, P., Quilodrán, L., Bertrán, C., Arismendi, I., Tapia, J., Peña-Cortés, F., … & Vargas-Chacoff, L. Rainbow Trout diets and macroinvertebrates assemblages responses from watersheds dominated by native and exotic plantations Ecological Indicators. 60, 655-667

2016. Fernández-Soto, E., Peña-Cortés, F. Aplicación de un modelo hidrológico espacialmente distribuido en dos cuencas costeras de la Región de La Araucanía (Chile) Estudios Geográficos. 77(280), 35-56. Publicado ISSN: 0014-1496

2016. Bertrán, C., Fierro, P., Encalada, E., Peña-Cortés, F., Tapia, J., Hauenstein, E., & Vargas-Chacoff, L. Macrobenthos of the coastal Budi Lagoon, southern Chile: Changes associated with seasonal environmental variation Brazilian Journal of Oceanography. 64(3), 239-248 Publicado ISSN: 1679-8759

2016. Pincheira-Ulbrich, J., Hernández, C. E., Saldaña, A., Peña-Cortés, F., & Aguilera-Benavente, F. Assessing the completeness of inventories of vascular epiphytes and climbing plants in Chilean swamp forest remnants New Zealand Journal of Botany. 54(4), 458-474

2015. Fierro, P., Bertrán, C., Mercado, M., Peña-Cortés, F., Tapia, J., Hauenstein, E., … & Vargas-Chacoff, L. Landscape composition as a determinant of diversity and functional feeding groups of aquatic macroinvertebrates in southern South American rivers Latin American Journal of Aquatic Research. 43(1), 186-200

2014. Hauenstein, E., Peña-Cortés, F., Bertrán, C., Tapia, J., Vargas-Chacoff, L. & Urrutia, O. Composición florística y evaluación de la degradación del bosque pantanoso costero de temu-pitra en la Región de La Araucanía, Chile Gayana Botánica. 71(1), 43-57 Publicado ISSN: 0016-5301

2014. Carrasco, S., Hauenstein, E., Peña-Cortés, F., Bertrán, C., Tapia, J. & Vargas-Chacoff, L. Evaluación de la calidad de vegetación ribereña en dos cuencas costeras del sur de Chile mediante la aplicación del índice QBR, como base para su planificación y gestión territorial (Chile) Gayana Botánica. 71(1), 1-9

2014. Tapia, J., Vargas-Chacoff, L., Bertrán, C., Peña-Cortés, F., Hauenstein, E., Schlatter, R., Valderrama, A., Lizama, C. & Fierro, P. Accumulation of potentially toxic elements in sediments in Budi Lagoon, Araucanía Region, Chile Environmental Earth Sciences. 72(11), 4283-4290

2014. Peña-Cortés, F., Limpert, C., Andrade, E., Hauenstein, E., Tapia, J., Bertrán, C. & Vargas-Chacof, L. Dinámica geomorfológica de la costa de La Araucanía Revista de Geografía Norte Grande. 58, 241-260

2013. Munita, D., Peña-Cortés, F. & Farias, A. Arqueología y Planificación Territorial en Chile, Situación Actual y Perspectivas, El caso de estudio de la provincia de Cautín, Región de la Araucanía, (Chile) Chungará. 45(2), 293-310

2013. Gutiérrez, P., Peña-Cortés., F. & Cisternas, M. Repoblamiento, actividades productivas y percepción del riesgo en corral 50 años después del tsunami de 1960, (Chile) Revista de Geografía Norte Grande. 56, 207-221. Publicado

2013. Bertrán, C., Jiménez, C., Fierro, P., Peña-Cortés, F., Tapia, J., Hauenstein, E. & Vargas-Chacof, L. Alimentación de Micropogonias furnieri (Osteichthyes: Sciaenidae) en el lago costero Budi, Sur de Chile Revista de Biología Marina y Oceanografía. 48(1), 193-197. Publicado ISSN: 0717-3326

2012. Fierro, P., Bertrán, C., Mercado, M., Peña-Cortés, F., Tapia, J., Hauenstein, E. & Vargas-Chacoff, L. Benthic macroinvertebrate assemblages as indicators of water quality through application of a modified biotic index in a spatio-seasonal context in a coastal basin in southern Chile Revista de Biología Marina y Oceanografía. 47(1), 23-33

2012. Tapia, J., Vargas-Chacoff, L., Bertrán, C., Peña-Cortés, F., Hauenstein, E., Schlatter, R., Jiménez, C. & Tapia, C. Heavy metals in the liver and muscle of Micropogonias manni fish from Budi Lake, Araucania Region, Chile: potential risk for humans Environmental Monitoring and Assessment. 184(5), 3141-3151

2012. Alfaro, D. & Peña-Cortes, F. Potencial acuícola en áreas preandinas de la región de La Araucanía: conflictos de uso con la actividad turística Revista de Geografía Norte Grande. 51, 137-157 Publicado ISSN: 0718-3402

2011. Peña-Cortés, F., Pincheira-Ulbrich, J., Bertrán, C., Tapia, J., Hauenstein, E., Fernández, E. & Rozas, D. A study of the geographic distribution of swamp forest in the coastal zone of the Araucanía Region, Chile Applied Geography. 31(2), 545-555.

2011. Torres-Álvarez, O. & F. Peña-Cortés. Zonificación del potencial energético de la biomasa residual forestal en la cuenca del lago Ranco, Chile, Antecedentes para la planificación energética regional Bosque. 32(1), 77-84

2011. Peña-Cortés, F., Escalona-Ulloa, M., Pincheira-Ulbrich, J. & Rebolledo, G. Cambios de uso de suelo en los geosistemas de la cuenca costera del río Boroa entre 1994 y 2004, Chile Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias. 43(2), 35-45. Publicado ISSN: 1853-8665

2018–2021. Escenarios participativos para el ordenamiento territorial: hacia la sustentabilidad del paisaje en las regiones de la Araucanía y Los Ríos. FONDECYT 1181954. Investigador Responsable.

2018–2020. Plan energético regional: un instrumento para la planificación estratégica y el fortalecimiento de la competitividad de la Región de La Araucanía. INNOVACHILE CORFO 18BPCR-102251. UCT. Investigador Responsable.

2018-2020. Gestión del riesgo de desastre ante la ocurrencia de eventos catastróficos, a través de escenarios prospectivos de soporte decisional. Un aporte piloto geoespacial para el fortalecimiento de la resiliencia en la región de La Araucanía, Chile. FONDEF ID18I10217. UCT. Investigador Responsable.

2018–2022. Sentido del lugar como conocimientos educativos y territoriales mapuches para una educación intercultural. FONDECYT 1181531. Co-investigador.

2016–2018. Fortalecimiento del Destino Turístico Temuco: Articulación de actores para el mejoramiento del capital social, la competitividad y el desarrollo económico y social. CONICYT VCE6000022 de Vinculación Ciencia Empresa. UCT. Investigador Responsable.

2015–2018. Escenarios prospectivos del paisaje para la planificación territorial: Un marco adaptativo de apoyo a las decisiones en espacios costeros integrando modelación de cambio de uso/cobertura de suelo y dinámica de producción de servicios ecosistémicos. FONDECYT 1151375. Investigador Responsable.

2015–2017. KimGen Lab: Laboratorio virtual de riesgos naturales de Chile. FONDEF IT14I10099. UCT. Investigador Responsable.

2014–2018. Conocimientos geográficos y territoriales mapuches: una base para la formulación de contenidos educativos interculturales pertinentes y contextualizados. FONDECYT 1140490. Co-Investigador.

2013–2015. Huellas de Neruda: Modelo tecnológico de gestión turístico-territorial inteligente para la puesta en valor de una ruta patrimonial en Temuco, Región de La Araucanía. INNOVACHILE CORFO 12BPCR – 16617. UCT. Investigador Responsable.

2012–2014. KimGen Red: Aprendizaje de la geografía local y global, y de sus riesgos naturales, utilizando sistemas colaborativos móviles multiplataforma. FONDEF TIC – EDU TE12I1015. UCT. Investigador Responsable.

2011–2015. Determinación de indicadores geográfico – ambientales y de riesgo natural en el paisaje de La Araucanía y Los Ríos: herramientas de soporte decisional para la planificación y gestión territorial en sistemas costeros. FONDECYT 1110798. UCT. Investigador Responsable.

2011–2014. Centro de Investigación de educación en contexto indígena e intercultural. Iniciativa Científica Núcleo Milenio, NS100045. Ministerio de Economía. UCT. Investigador Suplente (Alterno).

2011–2014. Epistemología del conocimiento mapuche y el escolar: un análisis desde la pedagogía intercultural, la geografía y sociología educacional. FONDECYT 1110489. UCT. Co-Investigador.