Actualmente de los 16 programas de posgrado activos, se han acreditado tres Doctorados (Doctorado en Educación, Doctorado en Ciencias Agropecuarias y Doctorado en Estudios Interculturales) y los siguientes programas de Magíster: Magíster en Planificación Territorial, Magíster en Matemáticas Aplicadas y recientemente el Magíster en Educación, acreditado por un período de 4 años.
